萝莉×大叔组合！次元间电磁诱导装置被誉为21世纪最伟大的发现和发明，而通过该装置发电已经成为了可能，并且影响了整个世界。如今，刻画科学与人类未来的“progressivesF”启动！

距今超过六千年的远古世界，天地割裂的凄惨战争持续不断，毫无还手之力的人类被拥有强大力量的各个种族逼入绝境，濒临灭亡。此时率领人类的年轻领袖里克，与机凯种少女休比偶然相遇。被同伴抛弃的休比，为了修复故障

成为“第三次冲击”元凶的碇真嗣，变得像废人一样……真嗣还能振作起来吗？2012年《福音战士新剧场版：Q》之后，这部动画讲述了被封印的故事的后续。

故事发生在一座位于孤岛之上的学校里，在这里学习的，都是身怀绝技的超能力者。这些孩子们被告知，在不久后的将来，即将发生灾厄，为了能够应对来袭的“人类之敌”，他们必须在这与世隔绝的孤岛上接受生存训练。外表

如果是为了你的话，我可以成为任何东西——。