U. C.0097时期，“拉普拉斯事变”的纷争终结后，2架独角兽高达被秘密封印，新吉翁残党“袖章”也随之瓦解。就在人类逐渐走出战争带来的阴影之时，失踪两年的独角兽三号机“凤凰”突然现身，拥有颠覆世界秩序力量的它即刻引发了地球联邦军、吉翁袖章残党以及路欧商会三方势力的争夺狩猎，一场宇宙对决也即将拉开帷幕......

故事以2020年东京奥运会之后的日本为背景，通过“极普通的家庭故事”，讲述了在日本逐渐沉没的情况下，面对终极选择的人们的现实生活。

怪盗绅士鲁邦一族的第三代继承人鲁邦三世，拥有智商300的天才头脑，精通艺术性的盗窃技巧。他与嗜好烟酒的枪手次元大介、他为之钟情的神秘女盗峰不二子、精通居合斩的第十三代石川五卫门以及常因为眨眼工夫就被鲁