香港警察方伟在侦破一件刑事犯罪案件时，执行卧底任务，不幸被犯罪团伙洪飞等人识破，方伟在与洪飞等人搏斗时将洪飞的弟弟击毙。洪逃走后杀死无辜的方伟的妻子，然后逃往内地。 方伟回内地探亲，在公共汽车上遭车匪

大内库藏武功秘笈《葵花宝典》失窃。东厂主管太监古今福（刘洵 饰）率千户欧阳全（张学友 饰）等，南下调查辞官锦衣卫林镇南，同时收用“五岳盟主”左冷禅（元华 饰）外围策应。华山派大弟子令狐冲（许冠杰 饰）

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政治部警官任达华，在追查一宗军火案时，怀疑机场海关货仓主管苗侨伟为案中内鬼，苗被停职调查，后更被杀。苗的妹妹凤及妹夫吕俱为特警队督察，怀疑苗之死与任有关，决定调查。却原来军火案乃苗之上司威龙与黑帮头子

探员蒋浩华（甄子丹 饰）因办案手段凌厉大胆常受上峰批评，最近接到外派任务，赴菲律宾接回证人苏权，由于苏权一案牵涉蒋浩华杀妻仇人狄克（张耀扬 饰），蒋浩华严阵以待，但还是被狄克抢得先机。出师不利的蒋浩华